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12043
SignalSilence® Atg13 siRNA I
siRNA
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SignalSilence® Atg13 siRNA I #12043

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SignalSilence® Atg13 siRNA I: Image 1

Western blot analysis of extracts from RD cells, transfected with 100 nM SignalSilence® Control siRNA (Unconjugated) #6568 (-), or SignalSilence® Atg13 siRNA I (+), using Atg13 Antibody #6940 (upper) or β-Actin (D6A8) Rabbit mAb #8457 (lower). The Atg13 Antibody confirms silencing of Atg13 expression, while the β-Actin (D6A8) Rabbit mAb is used as a loading control.

Supporting Data

REACTIVITY H

Application Key:

  • W-Western
  • IP-Immunoprecipitation
  • IHC-Immunohistochemistry
  • ChIP-Chromatin Immunoprecipitation
  • IF-Immunofluorescence
  • F-Flow Cytometry
  • E-P-ELISA-Peptide

Species Cross-Reactivity Key:

  • H-Human
  • M-Mouse
  • R-Rat
  • Hm-Hamster
  • Mk-Monkey
  • Mi-Mink
  • C-Chicken
  • Dm-D. melanogaster
  • X-Xenopus
  • Z-Zebrafish
  • B-Bovine
  • Dg-Dog
  • Pg-Pig
  • Sc-S. cerevisiae
  • Ce-C. elegans
  • Hr-Horse
  • All-All Species Expected

Product Usage Information

CST recommends transfection with 100 nM SignalSilence® Atg13 siRNA I 48 to 72 hours prior to cell lysis. For transfection procedure, follow protocol provided by the transfection reagent manufacturer. Please feel free to contact CST with any questions on use.

Each vial contains the equivalent of 100 transfections, which corresponds to a final siRNA concentration of 100 nM per transfection in a 24-well plate with a total volume of 300 μl per well.

Storage

SignalSilence® siRNA is supplied in RNAse-free water. Aliquot and store at -20ºC.

Product Description

SignalSilence® Atg13 siRNA I from Cell Signaling Technology (CST) allows the researcher to specifically inhibit Atg13 expression using RNA interference, a method whereby gene expression can be selectively silenced through the delivery of double stranded RNA molecules into the cell. All SignalSilence® siRNA products from CST are rigorously tested in-house and have been shown to reduce target protein expression by western analysis.

Quality Control

Oligonucleotide synthesis is monitored base by base through trityl analysis to ensure appropriate coupling efficiency. The oligo is subsequently purified by affinity-solid phase extraction. The annealed RNA duplex is further analyzed by mass spectrometry to verify the exact composition of the duplex. Each lot is compared to the previous lot by mass spectrometry to ensure maximum lot-to-lot consistency.

Background

Autophagy is a catabolic process for the autophagosomic-lysosomal degradation of bulk cytoplasmic contents (1,2). Autophagy is generally activated by conditions of nutrient deprivation but has also been associated with a number of physiological processes including development, differentiation, neurodegeneration, infection, and cancer (3). The molecular machinery of autophagy was largely discovered in yeast and referred to as autophagy-related (Atg) genes.

Atg13/Apg13 was originally identified in yeast as a constitutively expressed protein that was genetically linked to Atg1/Apg1, a protein kinase required for autophagy (4). Overexpression of Atg1 suppresses the defects in autophagy observed in Atg13 mutants (4). Autophagy requires a direct association between Atg1 and Atg13, and is inhibited by TOR-dependent phosphorylation of Atg13 under high-nutrient conditions (5). Similarly, mammalian Atg13 forms a complex with the Atg1 homologues ULK1/2, along with FIP200, which localizes to autophagic isolation membranes and regulates autophagosome biogenesis (6-8). mTOR phosphorylates both Atg13 and ULK1, suppressing ULK1 kinase activity and autophagy (7-9). ULK1 can directly phosphorylate Atg13 at a yet unidentified site, presumably to promote autophagy (7,8). Additional studies suggest that Atg13 and FIP200 can function independently of ULK1 and ULK2 to induce autophagy through an unknown mechanism (10).

  1. Reggiori, F. and Klionsky, D.J. (2002) Eukaryot. Cell 1, 11-21.
  2. Codogno, P. and Meijer, A.J. (2005) Cell Death Differ. 12 Suppl 2, 1509-18.
  3. Levine, B. and Yuan, J. (2005) J. Clin. Invest. 115, 2679-88.
  4. Funakoshi, T. et al. (1997) Gene 192, 207-13.
  5. Kamada, Y. et al. (2000) J Cell Biol 150, 1507-13.
  6. Ganley, I.G. et al. (2009) J Biol Chem 284, 12297-305.
  7. Hosokawa, N. et al. (2009) Mol Biol Cell 20, 1981-91.
  8. Jung CH et al. (2009) Mol Biol Cell 20, 1992–2003
  9. Kim, J. et al. (2011) Nat Cell Biol 13, 132-41.
  10. Alers, S. et al. (2011) Autophagy 7, 1423-33.

Pathways & Proteins

Explore pathways + proteins related to this product.

使用に関する制限

法的な権限を与えられたCSTの担当者が署名した書面によって別途明示的に合意された場合を除き、 CST、その関連会社または代理店が提供する製品には以下の条件が適用されます。お客様が定める条件でここに定められた条件に含まれるものを超えるもの、 または、ここに定められた条件と異なるものは、法的な権限を与えられたCSTの担当者が別途書面にて受諾した場合を除き、拒絶され、 いかなる効力も効果も有しません。

研究専用 (For Research Use Only) またはこれに類似する表示がされた製品は、 いかなる目的についても FDA または外国もしくは国内のその他の規制機関により承認、認可または許可を受けていません。 お客様は製品を診断もしくは治療目的で使用してはならず、また、製品に表示された内容に違反する方法で使用してはなりません。 CST が販売または使用許諾する製品は、エンドユーザーであるお客様に対し、使途を研究および開発のみに限定して提供されるものです。 診断、予防もしくは治療目的で製品を使用することまたは製品を再販売 (単独であるか他の製品等の一部であるかを問いません) もしくはその他の商業的利用の目的で購入することについては、CST から別途許諾を得る必要があります。 お客様は以下の事項を遵守しなければなりません。(a) CST の製品 (単独であるか他の資材と一緒であるかを問いません) を販売、使用許諾、貸与、寄付もしくはその他の態様で第三者に譲渡したり使用させたりしてはなりません。また、商用の製品を製造するために CST の製品を使用してはなりません。(b) 複製、改変、リバースエンジニアリング、逆コンパイル、 分解または他の方法により製品の構造または技術を解明しようとしてはなりません。また、 CST の製品またはサービスと競合する製品またはサービスを開発する目的で CST の製品を使用してはなりません。(c) CST の製品の商標、商号、ロゴ、特許または著作権に関する通知または表示を除去したり改変したりしてはなりません。(d) CST の製品をCST 製品販売条件(CST’s Product Terms of Sale) および該当する書面のみに従って使用しなければなりません。(e) CST の製品に関連してお客様が使用する第三者の製品またはサービスに関する使用許諾条件、 サービス提供条件またはこれに類する合意事項を遵守しなければなりません。

For Research Use Only. Not For Use In Diagnostic Procedures.
Cell Signaling Technology is a trademark of Cell Signaling Technology, Inc.
SignalSilence is a registered trademark of Cell Signaling Technology, Inc.
To Purchase # 12043S
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12043S
300 µl  (3 nmol)

Our Japan Office is Closed

Our Japan office is closed in observance of Respect of the Aged Day and Autumnal Equinox Day. We will reopen on Wednesday, September 23rd.

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